XDebug ist das sehr beliebte und allseits bewährte Tool, das nicht nur Stacktrace und var_dumps ausgeben kann, sondern ebenso für CodeCoverage, echtes Debuggen, Profiling und Testen mit PHPUnit gedacht ist.

XDebug kann Profiler Dateien erzeugen, die man mit KCacheGrind perfekt auswerten kann. So bleibt kein Flaschenhals in der Applikation unbemerkt.

xdebug.org
kcachegrind.sourceforge.net